بر اساس این نامه، معاون آموزشی دانشگاه تهران در تاریخ ۱۴۰۱/۶/۳۰ یعنی نخستین روزهای شروع بحران اخیر از «کارگروه بررسی صلاحیت عمومی» درخواست اعلام نظر درباره دکتر برهانی می کند و این کارگروه نیز متعاقبا در تاریخ ۱۴۰۱/۷/۹ مخالفت خود با ادامه عضویت وی در هیات علمی را اعلام می کند.

در گزارش فارس به نقل از یک «استاد دانشگاه تهران» دلایل مخالفت با حضور دکتر برهانی عجز علمی و دلایل مختلف دیگر از جمله حمایت‌های وی از ازدواج سفید و تجویز و ترویج ارتباطات غیر اخلاقی میان دانشجویان ذکر شده است.

فارس به نقل از این استاد دانشگاه ناشناس نوشته است: «برهانی از سال‌ها پیش، ازدواج سفید را نه فقط جرم نمی‌داند بلکه صحیح می‌داند و معتقد است آسیب‌های ازدواج سفید کمتر از آسیب‌های ازدواج موقت شرعی است؛ او تحت عنوان اینکه من فقیه هستم و فقه می‌دانم، حکم ضروری شرعی را رد و دانشجویان را گمراه می‌کند و به فساد می‌کشاند و باعث بدنامی دانشگاه تهران شده است»

دکتر برهانی استادیار گروه حقوق جزا و جرم شناسی دانشکده حقوق و علوم سیاسی دانشگاه تهران مخصوصا در جریان حوادث اخیر برخی تصمیمات قضائی و برخوردها با مردم را از جنبه حقوقی و فقهی مورد تحلیل انتقادی قرار داده بود.

دیدگاه های تحلیلی و انتقادی دکتر برهانی در جریان حوادث اخیر عمدتا از طریق حساب توییتر وی منتشر می شد.

از دکتر محسن برهانی در طول سال های فعالیت وی مقالات علمی متعددی در نشریات علمی داخلی و خارجی منتشر شده است، مقالات منتشر شده در نشریات علمی داخلی اینجا قابل دسترسی و مطالعه هستند.

عناوین برخی مقالات منتشر شده از دکتر محسن برهانی در نشریات علمی به شرح زیر است:

– قلمرو زمانی توبه در تعزیرات با تأکید بر رأی وحدت رویه شماره ۸۱۳ هیئت عمومی دیوان عالی کشور. برهانی محسن, لطفعلی زاده الهه (۱۴۰۱)., مجله حقوقی دادگستری, ۸۶(۱۱۸), ۱-۱۹.

– عزاداری های نامتعارف در پرتو حقوق کیفری  و رویه قضائی ایران. برهانی محسن, محمدی محمد (۱۴۰۰)., فصلنامه دیدگاه های حقوق قضایی, ۲۶(۹۵), ۱۰۷-۱۲۶.

– نقد دام گستری در جرایم مواد مخدر مستوجب اعدام. برهانی محسن, سیاوشی سامان (۱۴۰۰)., پژوهش های اطلاعاتی و جنایی, ۱۶(۲), ۳۱-۶۰.

– جایگاه نظر کارشناس در احراز رابطه سببیت. برهانی محسن, بادکوبه هزاوه آرش (۱۴۰۰)., مجله حقوقی دادگستری, ۸۵(۱۱۳).

– قدرت، دانش و زایش معنا بنیادی برای توضیح شیوه پدیداری دولت. مدی بهنام, برهانی محسن (۱۳۹۹)., دولت پژوهی, ۶(۲۳).

– معیارهای ناظر بر شناسایی مفسد فی الارض با تأکید بر جرائم مواد مخدر. برهانی محسن, احمدزاده رسول (۱۳۹۷)., مطالعات حقوق کیفری و جرم شناسی, ۴۸(۲).

– مصداق شناسی موضوعات در حقوق کیفری ایران. برهانی محسن, پارساییان عطیه (۱۳۹۷)., فقه و مبانی حقوق اسلامی, ۵۱(۲).

– functionalism and crime. Borhani Mohsen, mehrdad Maryam (2018)., ZEITSCHRIFT FUR ETHNOLOGIE, 143(2).

– مفهوم و جایگاه عنف در حقوق کیفری ایران. برهانی محسن, دادجو مهسا (۱۳۹۶)., حقوق اسلامی, سال چهاردهم(۵۳).

– تقلیل گرایی نسبت به مجازات های سالب حیات در حقوق کیفری ایران. برهانی محسن, رادمند محمدامین (۱۳۹۶)., فصلنامه راهبرد, سال بیست و ششم(۸۲).

– کمال گرایی کیفری. برهانی محسن, محمدی فرد بشری (۱۳۹۵)., مطالعات حقوق کیفری و جرم شناسی, ۳(۲).

– افساد فی الارض ابهام مفهومی مفاسد عملی. برهانی محسن (۱۳۹۴)., مطالعات حقوق کیفری و جرم شناسی, دوم(۲-۳).

– تعزیرات منصوص شرعی: مفهوم فقهی و مصادیق عملی. برهانی محسن, نادری فرد مریم (۱۳۹۴)., پژوهش حقوق کیفری, سوم(۱۰).

– نقش عرف در تحلیل مولفه روانی جرم وعوامل روال مسئولیت کیفری. برهانی محسن, پارساییان عطیه (۱۳۹۲)., پژوهشهای حقوقی, ۳(۲).

– عرف و مولفه های قانونی و مادی تشکیل دهنده پدیده مجرمانه. برهانی محسن, پارسائیان عطیه (۱۳۹۲)., حقوق اسلامی, ۱۰(۳۶), ۱۴۷-۱۷۰.

– جرم انگاری حقوق بشری؛ خود مختاری و مقتضیات صحیح اخلاقی. برهانی محسن (۱۳۹۱)., پژوهش های حقوق جزا و جرم شناسی, ۱(۲), ۵.

– گستره تنبیه بدنی اطفال بوسیله والدین از منظر قانون و فقه. برهانی محسن (۱۳۹۱)., فصل نامه مطالعات حقوق خصوصی, ۴۲(۳), ۷۳-۸۷.

– چرایی جرم انگاری در قلمرو اخلاق زیستی. برهانی محسن,  محمدرضا رهبرپور (۱۳۹۰)., فصل نامه مطالعات حقوق خصوصی, ۴۱(۴), ۴۱-۵۹.

– ارتداد علت موجهه یا عذر قانونی. برهانی محسن (۱۳۹۰)., مجله مطالعات حقوقی دانشگاه شیراز, ۴۱(۲), ۴۱-۵۸.

– چرایی تبعیت از قانون. حسینی سیدمحمد, برهانی محسن (۱۳۸۹)., پژوهش های فلسفی – کلامی, ۱۱(۴۴-۴۳), ۲۳۹-۲۵۹.

– جایگاه آموزه های اخلاقی در استنباط فقهی. برهانی محسن (۱۳۸۸)., فقه پزشکی, ۱(۱), ۴۳-۶۶.